遥远的未来，地球一度变成冰冻星球。幸存的人类移民外太空，建立了繁荣的殖民星球阿瓦隆，并与外星人成立人类银河联盟。与此同时，名为希迪尔斯的异形肆虐繁殖，与联盟展开旷日持久的战争。在一次针对希迪尔斯母星的战役中，年仅16岁的少尉雷德（石川界人 配音）所在部队遭遇猛烈抵抗。撤退途中，雷雷德不慎被卷入时空裂缝，与他所驾驶的歼灭兵器钱伯坠落在地球的汪洋中。钱伯被人类打捞到加尔刚蒂亚舰团之上，面对这个与印象中完全不同的人类发源之星，雷德不知所措。在此期间，他和可爱的少女艾米（金元寿子 配音）沟通交流，并成功帮助他们挫败海盗的进攻，赢得地球人的信任。 由于无法联系到友军，雷德只能暂时留在地球。自幼只知道战斗和服从命令的他，面对这群全无纪律和效率可言的人类，心中最深层的情感慢慢苏醒……

用语解说

人类银河同盟（人类银河同盟）

同盟成员有4亿7000万人。透过讨伐黑迪亚斯，从而维护人类的安定。身体较弱者会被视为劣等者以及淘汰。拥有军队。军人执行军务的时间达到14万5000小时便拥有限定市民权、申请在同盟的根据地?阿瓦隆进行四星期的旅游与滞留资格（拥有自由睡眠、自由饮食以及生殖的自由）。其起源是在旧文明时代提倡以宇宙船进出宇宙，并强行与EVOLVER=自发进化推进派进行战争冲突的“大陆联盟”。在同盟内，西迪亚斯的诞生以及与其所发生的战争都被视为机密资料。

鲸鱼乌贼（クジライカ）

形状类似一只巨大的鱿鱼，是地球最强的海洋生物。加尔冈蒂亚船团的住民视它为神圣的生物。特征与西迪亚斯相似，由DNA分析证实与黑迪亚斯是同种生物。不会主动对人类进行攻击，但受到攻击就会狂暴化，而加尔冈蒂亚船团的装备亦不可能与其进行对抗。人类适应宇宙实验的先行海中适应实验产物，其实验体的后裔、西迪亚斯的原型，称为 “共生体”（共生体），由旧文明时代的人类制造，能呼吸海中的氧气，还可承受深海的水压。通过纳米机械“光虫”共生进行营养补给，和光合作用相似，但效率更高。

西迪亚斯（ヒディアーズ）

是未来太空中的人类一直与之艰苦战斗的异形生命体，外表很像乌贼，可通过光合作用生存，且体质极佳，并能够适应缺氧低温环境。在第9话揭示出西迪亚斯原本是人类为了适应环境而进行的人工进化，与坚持人类一直的特性的银河联盟“原地球大陆联盟”因各种原因（主要是伦理道德）而敌对。原始品种保有思考能力，但是后来出现的那些变种尚不能确定。

光虫（ヒカリムシ）

是渡过地球寒冷化后人类能源的来源。同时也是能证明西迪亚斯记录影像真伪的事实。本质是一种高科技纳米机械所构成拟似生体组织，由于当初设计的可能考虑的用处使得其能够像生物一样的复制自我。吸收电磁波后便能高效地转化为能源，不光可以提供大量能量，其本身的结构使得其能够组成坚硬的外壳，并通过自我复制进行“成长”，组成鲸鱼乌贼的皮膜及触手，在宇宙则是西迪亚斯的主要防护手段和生存手段的外壳。